כבכל טיפול רפואי, גם לטיפול בקרינה עלולות להיות תופעות לוואי. תופעות הלוואי משתנות בהתאם לאזור המטופל ותלויות בעוצמת הקרינה הניתנת. תופעות הלוואי יחלו לרוב מספר ימים לאחר תחילת הטיפול הקרינתי ויחלפו כ-3 שבועות מסיומו.
תופעות הלוואי הנפוצות והמאפיינות כל טיפול קרינה הן עייפות וחולשה בתקופת הטיפול ואשר חולפות לאחריו. יתר תופעות הלוואי משתנות ממטופל למטופל בהתאם לאזור שהוקרן ולפרמטרים נוספים כמו עוצמת הקרינה וחלקן אף עלולות ליצור פגיעה לטווח ארוך.
במהלך שלב הייעוץ ובדיקת הרדיולוג ניתן לקבל את כל המידע על תופעות הלוואי הצפויות בעקבות הטיפול וכיצד ניתן להתמודד איתן. על כל תופעת לוואי חריגה יש לעדכן את הצוות המטפל.