מחלקת הילדים בהדסה הר-הצופים היא מחלקת אשפוז ילדים הגדולה ביותר בירושלים. המחלקה נותנת שירותים רפואיים לילדי אזור ירושלים רבתי. המחלקה ממוקמת בצפון ירושלים, אזור המאוכלס בעיקר על-ידי משפחות צעירות ומרובות ילדים. חטיבת הילדים בהדסה הר הצופים כוללת מחלקת פגים, מחלקה לכירורגית ילדים, פסיכולוגיה של הילד ופיזיותרפיה.
מחלקת ילדים בהדסה הר הצופים כוללת רופאי ילדים בכירים, רופאים מתמחים, אחיות, תזונאיות לילדים, עובדות חינוכיות ועובדת סוציאלית. מרבית הרופאים רכשו את השכלתם הרפואית ואף עוסקים בהוראה בבית הספר לרפואה של האוניברסיטה העברית בירושלים וכן עוסקים במחקרים קליניים. מחלקת ילדים א' ומחלקת ילדים ב' נמצאות בקומה 5 של בניין האשפוז.
מנהלת:
ד"ר רבקה ברוקסמחלקת ילדים בהדסה הר הצופים מעניקה שירותים רפואיים ברמה גבוהה ביותר לילדים ללא הבדלי רקע דתי או לאומי בהתאם לצרכיו האישיים של כל ילד וילד.