בהדסה ילדים ניתן מענה לכל בעיה רפואית בתחום בריאות הילד. מיטב הרופאים פועלים במסגרת אגף הילדים על מחלקותיו בעין כרם ובהר הצופים, חוברים אליהם רופאי המחלקה לכירורגית ילדים ומומחי העל במקצועות הכירורגים כמו אורטופדיה, אורולוגיה, ניתוחי לב בילדים, עיניים, אף אוזן גרון, והתמחויות על נוספות. לצד כל אלה פועל צוות סיעודי גדול ומיומן, המתאפיין בגישה מיוחדת לילדים.