בתחום אנדוקרינולוגיה ילדים, קיימות מרפאות בשני הקמפוסים - בעין-כרם ובהר-הצופים.
המרפאות עוסקות בהערכה של בעיות הורמונליות בגיל הילדות מכל הסוגים. בשל קשר קרוב עם מעבדות משוכללות של המרכז הרפואי והאוניברסיטה קיימת הצלחה באבחון וטיפול בבעיות רפואיות סבוכות שיש בהן מרכיב הורמונלי וזאת בנוסף לטיפול ומעקב שגרתי בבעיות הורמונליות שכיחות של גיל הילדות כגון הפרעות גדילה, הפרעות בתהליך ההתבגרות המינית, מאזן הסידן ובניית העצם, בלוטת התריס ועוד. בנוסף, בעין-כרם קיים מעקב אנדוקריני ארוך טווח אחרי ילדים שהחלימו ממחלות ממאירות או עברו השתלת מיח עצם לטיפול במחלות גנטיות. בהר הצופים, נוטלים רופאי היחידה חלק בטיפול ומעקב בחולים במרפאה למחלות כרוניות.
בנוסף למרפאות מתבצעים תבחינים אנדוקריניים דינמיים בשני הקמפוסים הן כחלק מבירור מקרים המגיעים למרפאותינו והן כשירות הניתן לרופאים אנדוקרינולוגים העובדים בקהילה בירושלים ובסביבתה.
התחום בהדסה מאושר כיחידה על ידי המועצה המדעית של ההסתדרות הרפואית לצורך הכשרה של רופאים באנדוקרינולוגיה ילדים. מספר רופאים כבר עברו הכשרה במסגרת זו.
תחומי הפעילות ביחידה לאנדוקרינולוגיה ילדים כוללים אבחון, טיפול ומעקב אחר ילודים, תינוקות, ילדים ומתבגרים הסובלים מהפרעות הורמונליות: כגון
- סוכרת נעורים
- הפרעות בגדילה וקומה נמוכה
- התבגרות מינית מוקדמת/מאוחרת
- הפרעות בתפקוד בלוטת התריס
- השמנת יתר
- שיעור יתר
- הפרעות בתפקוד בלוטת יותרת-הכליה
- הפרעות במבנה אברי המין על בסיס הורמונלי
- הפרעות במשך הסידן
- תסמונת טרנר
- ביצוע תבחינים אנדוקריניים דינמיים לאבחון יסודי של בעיות הורמונליות שונות