המעבדה לפתולוגיה של העין בבית החולים הדסה שהוקמה על ידי פרופסור יעקב פאר היא הראשונה מסוגה בארץ. במעבדה מתקבלות רקמות ממחלקת עיניים בבתי החולים של הדסה וכן ממחלקות עיניים אחרות בארץ לצורך ייעוץ. מדי שנה נבדקות במעבדה כ-500 דגימות רקמה. המעבדה נותנת שירותי צביעות היסטולוגיות שונות כולל צביעות אימונוהיסטוכימיות.
בנוסף לשירות הקליני המעבדה משרתת את החוקרים של מחלקת עיניים, בעיקר לצורך הכנת חתכים היסטולוגיים למחקריהם. סטודנטים רבים ביצעו את עבודות המחקר שלהם במעבדה, וזאת בנוסף למתמחים ממחלקת עיניים וממחלקות אחרות בארץ ובעולם. נוסף על אלה המעבדה נותנת שירות גם לחברות העוסקות בפיתוח טיפולים לעיניים.
צוות מעבדת פתולוגיה של העין כולל את פרופ' שחר פרנקל, פרופ' יעקב פאר והטכנאית גב' ילנה פונטק.