לב הפעילות של מחלקת הרדמה הוא כמובן בחדרי הניתוח, הנמצאים בכמה מוקדים:
- 13 חדרים במתחם חדר הניתוח המרכזי
- 10 חדרים במתחם חדרי הניתוח של אשפוז יום
- 3 חדרי ניתוח במחלקת עיניים
- 2 חדרי ניתוח בחדר לידה
- 10 חדרי ניתוח בהר הצופים
בשני בתי החולים של המרכז הרפואי הדסה מבוצעים למעלה מ-40,000 ניתוחים בשנה במגוון תחומים בידי כל מחלקות האגף הכירורגי של המרכז הרפואי. חדרי הניתוח פועלים 24 שעות ביממה, 7 ימים בשבוע. רופאי האגף נותנים מענה לניתוחים מתוכננים, לניתוחי חירום ולניתוחים דחופים, וערוכים גם לאפשרות של אירוע רב-נפגעים, חס וחלילה.