המחלקה להשתלות מח עצם בהדסה עין כרם החלה את פעילותה בשנת 1981, והייתה החלוצה בתחום השתלות מח עצם בארץ. מאז ועד היום בוצעו במחלקה מעל 4000 השתלות מסוגים שונים כאשר יותר מחצי מהן הינן השתלות מתורם (השתלות אלוגנאיות) וכאלף מהן בוצעו בילדים, מרביתן אלוגנאיות.
כיום המחלקה להשתלות מח עצם בהדסה עין כרם היא אחת המחלקות הגדולות בישראל ובאירופה וכוללת 25 מיטות השתלה. המערך, המורכב ממחלקה ואשפוז יום, מרפאה אימונולוגית, יחידת פרזיס ויחידה לעיבוד תאים, מעניק טיפול למבוגרים ולילדים.
המחלקה להשתלות מח עצם ,בראשותה של פרופ' פולינה סטפנסקי, נמצאת בחזית תחום השתלות, האימונולוגיה, האימונותרפיה וטיפול תאי בארץ ובעולם. במחלקה מבוצעות מדי שנה מעל 150 השתלות מסוגים שונים ביניהן: השתלות עצמיות, השתלות מתורם במשפחה, השתלות מתורם זר, עם התאמות מלאות וחלקיות (הפלואידנטיות) וכן השתלות מדם טבורי.
צוות המחלקה מגוון וכולל צוות רפואי, צוות סיעודי (כ-50 אחיות) וצוות פרה-רפואי הנותנים מענה כוללני למטופל ומשפחתו במשך כל שעות היממה. הצוות הפרה-רפואי כולל צוות פסיכוסוציאלי, דיאטנית, פיזיותרפיסט, מורות מבית הספר ומתנדבים במסגרת פרויקטים שונים, שעובדים בשיתוף פעולה עם הצוותים, לרווחת המטופלים והמשפחות.
בנוסף, למחלקה יחידת פרזיס ועיבוד תאים, בה עובד צוות מסור ומנוסה שאמון על אסופי מח עצם והכנת שתלים, מעבדה לאימונו דיאגנוסטיקה, יחידת מחקר ופיתוח שעוסקת בפיתוח טיפולים חדשניים, מתאמות השתלה, יחידה למחקרים קליניים ויחידה לעיבוד נתונים. כל אלו מעניקים מענה לתחומים רבים ומגוונים הקשורים לפעילות קלינית ומחקרית של המחלקה.
מחלקת השתלות הינה בין המובילות בארץ בטיפול במחלות ממאירות באמצעות השתלה עצמית או השתלה מתורם. למחלקה ניסיון עשיר וייחודי בתחום השתלות מח עצם במחלות לא ממאירות, כולל אבחון של מחלות גנטיות קיימות וחדשות הגורמות להפרעות בתפקוד מערכת החיסון או מח העצם. באוגוסט 2019 הורחבה המחלקה בבניין שרת ונפתח אגף חדש להשתלות מח עצם בילדים הכולל 8 מיטות אשפוז חדשות.
צוות המחלקה חבר בארגונים בין לאומיים, הן בתחום ההשתלות, והן בתחום מחלות המטולוגיות ואימונולוגיות. המחלקה נוטלת חלק במחקרים קליניים בין לאומיים ויוזמת מחקרים קליניים מקומיים.
צוותי המערך פועלים על פי הסטנדרטים הגבוהים ביותר. בתחילת שנת 2019 המחלקה ומערך העיבוד ואיסוף התאים, עברו תהליך אקרדיטציה וקיבלו תו תקן בינלאומי בתחום האיכות והבטיחות,JACIE Accreditation .בזאת, הפכה המחלקה לראשונה ויחידה בישראל עם תקן בין לאומי ל ליחידת האסוף ועבוד תאים ולעבודה הקלינית במחלקה.
במערך מתבצעות, בנוסף לפעילות הקלינית, פעילות אקדמית רבה ומגוונת. מדי שנה המחלקה מציגה בכנסים בארץ ובעולם, מתפרסמות עבודות מדעיות רבות, מתקבלים מענקי מחקר בין לאומיים וקיימת הדרכת סטודנטים לרפואה ולסיעוד המגיעים ללמוד על התחום ולהתמקצע.
המחלקה הייתה ונשארה חלוצה במחקר בסיסי וקליני בתחום השתלות מח עצם. צוות המחלקה עוסק במחקר מדעי מגוון, בנושאים שונים הכוללים גנטיקה, אימונולוגיה וטיפול תאי. במסגרת הפעילות המחקרית, התגלו מספר גנים חדשים הגורמים למחלות של מערכת החיסון ושל מח העצם, ובוצעו השתלות מוצלחות בשיטות מתקדמות לראשונה בארץ ובעולם. לאחרונה המחלקה הוסמכה על ידי חברת NOVARTIS למתן טיפול ע״י תאים מהונדסים גנטית - CART cells.
בימים אלו, צוות המחלקה מפתח טיפולים חדשניים הכוללים שימוש בתאים של מערכת החיסון (כגון תאים מזנכימליים לטפול במחלת השתל כנגד המאכסן ותאים כנגד זיהומים נגיפיים) והנדסה גנטית של תאי מערכת החסון כנגד מחלות ממאירות שונות (In house engineered CART cells).