המחלקה לכירורגית ילדים מטפלת בתינוקות ובילדים עד גיל 16. ניתן ייעוץ טרום - לידתי כאשר מתגלים ממצאים בבדיקות טרום – לידתיות. ולאחר הלידה המחלקה מציעה את שרותיה בהתייעצות ובניתוחים בין השאר, בנושאים הבאים:
v ניתוחי מומים מולדים בוושט, בקיבה, במעי הדק, ובמעי הגס; מומים מולדים בפי הטבעת.
v מומים מולדים בריאות, במערכת השתן, בדופן הבטן וכ"ד.
v ניתוחים לגידולים בתינוקות ובילדים.
v ניתוחים לבקעים ("שבר") מפסעתיים ואחרים, טמירות אשכים.
במחלקה מבוצעים ניתוחים בשיטות לפרסקופיות וטורקוסקופיות מתקדמות, כגון: ניתוחים במערכת העיכול, ניתוח למניעת רפלוקס מהקיבה לוושט, כריתת טחול, כריתת כיס המרה, ביופסיה וכריתת גידולים שונים, ניתוח למניעת הזעת יתר בידיים (סימפטקטומיה), ביופסיות ריאתיות ועוד.