הפרעות בפוריות והפרעות אחרות בתפקוד המיני של הגבר הנם תלונות נפוצות. הסיבה להפרעות אלה היא לרוב רפואית עקב פגיעה בתפקוד או מבנה הפין או עקב מחלות במערכת העצבים, כלי הדם וההורמונים המעורבים בתפקוד המיני של הגבר. אורולוגים עוסקים בבירור וטיפול בהיבטים הגופניים של הפרעות מעין אילו בעוד סקסולוגים מטפלים בהיבטים הרגשיים והנפשיים. מרפאת האונות (תפקוד מיני) של מחלקת אורולוגיה בהדסה עין כרם מציעה את כל הבדיקות והטיפולים הנדרשים להתמודדות עם בעיות בתפקוד המיני.
הפרעות בפוריות ועקרות הגבר – זוגות רבים סובלים מבעיות של עקרות כאשר לעיתים קרובות קיים ליקוי בפוריות הגבר. אורולוגים עשויים לעזור באבחון מקור הבעיה ולהציע טיפולים תרופתיים וניתוחיים לשיפור פריון הגבר. כמו כן במקרים מורכבים בשיתוף עם גניקולוגים מתחום פוריות האישה לעזור בהפקת זרע מהגבר לצורך שיטות של הפריה מלאכותית.