המחלקהה פנימית של הדסה עין כרם הינה מרכז שלישוני לרפואה פנימית, הכולל 3 מחלקות אשפוז, יחידת אשפוז יום ויחידת טיפול נמרץ פנימי.
כמו כן, היא כוללת את השרותים לגסטרונטרולוגיה, נפרולוגיה ואנדוקרינולוגיה, וכן יחידות המתמחות באטרוסקלרוזיס, גריאטריה, מחלות כבד, סוכרת, ראומטלוגיה, אימונולוגיה קלינית ואלרגיה, ריאות, תזונה והפרעות אכילה.
המחלקה מטפלת בחולים מורכבים מכל רחבי המדינה ועוסקת במחקר קליני וביו-רפואי מתקדם באמצעות מגוון מרכזי מצויינות ובהוראה לסטודנטים לרפואה ומתמחים.
המחלקה דוגלת בפיתוח גישה מולטי-דיסציפלינארית המשלבת טיפול רפואי, מחקר והוראה תחת מטריה מחלקתית אחת.