המחקר במחלקה מתמקד בשני מישורים:

 המחקר הבסיסי במעבדת המחקר שברשות המחלקה

 המחקר הקליני שיעסוק במחקרים פרוספקטיביים ורטרוספקטיביים

מחקר בסיסי במעבדת המחלקה ובמעבדות המשתפות פעולה

המחקר המעבדתי מתבסס על פרוייקטים קיימים, המנוהלים ע"י אנשי צוות המחלקה וכפועל יוצא המשך פיתוח נושאים המשכיים של פרוייקטים אלו.

פרוייקטים קיימים:

1.    השפעת גורמי גדילה על ריפוי עצם - פרופ' שטייר, דר' רגב, דר' כספי (עבודה אחת כבר נשלחה לפרסום)

2.    השפעת הטראומה על רמת גורם גדילה גרמי דר' כספי, דר' רגב, פרופ' שטייר, פרופ' באב, פרופ' אסתי שוהמי (המודל פותח במעבדה שלה ומיושם למטרות העבודה של הקבוצה)

3.    השימוש בלובריקנטים שונים על תפקוד פרקי הלסת (פרופ' ניצן במעבדה לביוכימיה)

4.    קבוצה לחקר מנגנונים של כאבים נוירופטייים וכאבים כרוניים במעבדה לפיזיולוגיה בפקולטה לרפואת שיניים בה חבר פרופ' זלצר (עבודה על מודל שפותח במעבדה זו). 

פרוייקטים בתכנון לביצוע:

1.      השימוש בלייזר לחיתוך רקמה קשה - עצם ושיניים.  לרשות המחלקה לייזר מסוג Opus 20 שהוא Eb: Yag laser.  ד"ר זלצר היה חבר בועדה כלל-ארצית מטעם הר"ש בנושא פעילות הלייזר ברפאת השיניים ויהיה אחראי על הנושא במסגרת מרכז הלייזרים בפקולטה, שבראשה עומד פרופ' שטבהולץ.  המחקר בנושא יתבצע הן במעבדת המחלקה והן בקליניקה.

2.    פיתוח של ה-  Minimal invasive surgical techniques  - עם הצטרפות למחקר שמתבצע ע"י פרופ' קייבן בבוסטון.

העבודה המעבדתית מתקיימת בשיתוף עם

קבוצות מחקר בתחום המחקר הבסיסי.

תחומי מחקר אלו מחולקים לאחריותם של רופאים בכירים במחלקה שיש להם זיקה לנושא:

- פיתוח שיטות לאוגמנטציה של עצם לצורך השתלות

- הטיפול בכאב הכרוני והחריף

- מחקרים רטרוספקטיביים כטיפול בגידולים שמקורם בפה ובלסתות: גידולים מליגניים  בשיתוף עם רופאי המחלקה לאא"ג וכירורגיה פלסטית

- מחקרים רטרוספקטיביים ופרוספקיטביים כטיפול בעיוותים בעצמות הפנים – דר' רגב, דר' כספי ורופאי המחלקה לאורתודונטיה

- השתלות דנטליות בעזרת Image Guided Implantology (IGI)

הוגשה בקשה דרך "הדסית" לקיום מחקר מסוג זה אף הוגשה בקשה לועדת הלסינקי.

נערכו מפגשים בתיאום פרופ' שטייר, בין רופאי המחלקה ובין אנשי המחקר של חברת  Den Xלהכרת המכשור ולעיבוד תכניות המחקר. בראש צוות המחקר יעמוד פרופ' שטייר וישתתפו בו כל הרופאים הבכירים של המחלקה.

חברת Den X  תתרום ערכה לביצוע המחקר ובהמשך למחקרים נוספים שיהיו כפועל יוצא ממצאי העבודה.