המחלקה לרפואה דחופה (מלר"ד) מספקת טיפול רפואי לרוב החולים הזקוקים לטיפול דחוף ובשעת הצורך מקבלת ייעוץ של רופאים בכירים בכל התחומים.
במלר"ד קיים שירות רפואי גריאטרי שמספק טיפול רפואי לאכלוסיה שמעל גיל 70 כולל הערכה תפקודית.
בהר-הצופים אין יחידת טראומה ותת-התמחות כירורגית כמו נוירוכירורגיה וכירורגית לב-חזה. במידת הצורך החולה מועבר להמשך טיפול בבית החולים הדסה עין-כרם.
במלר"ד ניתנת הוראה לסטודנטים לרפואה בשנה ו', לרופאי משפחה ולסטודנטים בסיעוד ממגוון בתי חולים. כאן הם לומדים להתמודד עם חולים המציגים בעיות דחופות. המחלקה גם מוכרת לרוטציה למתמחים בפנימית ורופאי משפחה וכיום יכולה לספק התמחות ברפואה דחופה. מדי שבוע מגיעים בין 2-3 חיילים שנמצאים בקורס חובשים ועוברים פה הדרכה שניתנת על ידי הצוות הסיעודי.
חולה שמגיע לחדר מיון מקבל עם פתיחת תיק במשרד הקבלה, דף "מידע לפונה אל חדר המיון".